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图一:PGC1 alpha蛋白结构。图片来源:SWISS-MODEL。PGC1 alpha靶点介绍蛋白功能蛋白特性蛋白表达蛋白定位异构体 & 翻译后修饰WB实验贴士注意事项阳性对照阴性对照结果示例关键控制点参考文献PGC1 alpha靶点介绍蛋白功能 PGC1 alpha(过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活剂1-alpha)是类固醇受体和核受体的转录共激活剂。 PGC1 alpha增加解偶联蛋白启动子上PPARG和甲状腺激素受体的转录活性。 PGC1 alpha可以调节有助于适应性产热过程的关键线粒体基因。 PGC1 alpha通过协调参与葡萄糖和脂肪酸代谢的多种基因的表达,在响应膳食供应的代谢重编程中发挥重要作用。它的表达水平受长期能量供应的控制,在高脂饮食或肥胖环境下表达水平下降。 PGC1 alpha以ESRRA依赖性方式诱导骨骼肌中 PERM1 的表达。 PGC1 alpha参与昼夜节律和能量代谢的整合。通过激活RORA 和RORC以及代谢基因(如PDK4和PEPCK),调控生物钟基因(如ARNTL/BMAL1和NR1D1)的振荡表达。 PGC1 alpha长期以来被认为是治疗II型糖尿病、肥胖症、心肌病或其他代谢紊乱的潜在治疗靶点。 蛋白特性PGC1 alpha 的表达在不同组织间差异很大。它在适应性产热和能量代谢过程相关组织中高度表达。 PGC1 alpha在棕色脂肪分化早期被诱导,与白色脂肪细胞相比,它优先在成熟的棕色脂肪细胞中表达。 PGC1 alpha在人中有 9 种异构体,在小鼠中有 4种异构体。 蛋白表达在心脏、骨骼肌、肝脏和肾脏中高表达。 在大脑和胰腺中以较低水平表达。 在肠道和白色脂肪组织中的表达水平非常低。 蛋白定位PGC1 alpha的定位依赖于其乙酰化状态,可以定位于细胞质和细胞核中。在氧化应激(如活性氧)条件下变得更倾向定位于细胞核。 图二:PGC1 alpha ICC实验结果图,Anti-PGC1 alpha + beta抗体(ab72230)样本名称:HeLa细胞系绿色:PGC1 alpha + beta,红色:Tubulin,蓝色:DAPI结果描述:免疫荧光分析显示PGC1 alpha + beta在HeLa细胞核染色图三:PGC1 alpha ICC实验结果图,Anti-PGC1 alpha抗体(ab106814)样本名称:HeLa细胞系绿色:PGC1 alpha,蓝色:DAPI结果描述:免疫荧光分析显示细胞核和细胞质染色异构体 & 翻译后修饰人(Q9UBK2): 异构体 1 / B4 / B5: 90-92 kDa (预测) 异构体 9: 77 kDa (预测) 异构体 NT-7a / B4-8a / B5-NT / 8a: 30-33kDa (预测) 异构体 B4-3ext: 15 kDa (预测) 小鼠 (O70343): 异构体 1: 91 kDa (预测) 异构体 2-3: 41-42 kDa (预测) 异构体 4: 30 kDa (预测) 大鼠 (Q9QYK2): 91 kDa (预测) PGC1 alpha存在乙酰化、磷酸化和泛素化修饰 回到顶部 WB实验贴士注意事项PGC1 alpha多存在于细胞核中,所以在WB实验中使用核裂解液有助于获得理想实验结果。 PGC1 alpha只高表达于特定的组织细胞中,有些样本可能会出现弱表达或无表达的情况。请选择合适的实验样本,推荐使用阳性对照,以确认实验体系没有问题。 由于PGC1 alpha存在多种异构体,分子量差异较大(预测分子量15-92 kDa)。所以在WB实验中可能会出现多条条带,或实际检测到的条带大小与预测值不同。通常预测分子量77kDa的异构体只能在肝脏细胞中检测的到;预测分子量90 kDa的PGC1 alpha异构体可能在心脏、骨骼肌、肝脏和肾脏表达。有些样本可能检测到预测分子量为30 kDa的PGC1 alpha异构体。 建议使用新鲜制备的裂解液,尽量避免蛋白降解引起杂带现象。 阳性对照小鼠棕色脂肪组织、骨骼肌组织裂解液 人心脏组织裂解液 大鼠肾脏组织裂解液 分化的3T3-L1细胞和HepG2细胞裂解液 阴性对照小鼠白色脂肪组织裂解液 结果示例图四:Anti-PGC1 alpha抗体- N-terminal (ab191838)。样本名称:大鼠肾组织裂解液样本处理条件:5% NFDM/TBST封闭过夜,一抗室温孵育1h预测条带大小:91 kDa关键控制点在实验中除了需要注意常规问题外,还要特别关注以下关键控制点: 样本制备 添加足够量的蛋白酶抑制剂以避免靶标蛋白降解。 超声破碎样本以富集更多的PGC1 alpha靶标蛋白。 不要裁膜,保留全膜进行实验。 通过Bradford分析、Lowry分析或BCA分析测定样本总蛋白浓度。 转膜 强烈建议转膜完成后使用丽春红染色,确定转膜是否成功。 回到顶部参考文献D Knutti, A Kaul, A Kralli. (2000). A tissue-specific coactivator of steroid receptors, identified in a functional genetic screen. Mol Cell Biol. 20(7):2411-22.John E Dominy Jr, Yoonjin Lee, Zachary Gerhart-Hines, Pere Puigserver. (2010). Nutrient-dependent regulation of PGC-1alpha's acetylation state and metabolic function through the enzymatic activities of Sirt1/GCN5. Biochim Biophys Acta. 1804(8):1676-83.Joo-Ho Shin, Han Seok Ko, Hochul Kang, Yunjong Lee, Yun-Il Lee, Olga Pletinkova, Juan C Troconso, Valina L Dawson, Ted M Dawson. (2011). PARIS (ZNF746) repression of PGC-1α contributes to neurodegeneration in Parkinson's disease. Cell. 144(5):689-702.Yoshitake Cho, Bethany C Hazen, Aaron P Russell, Anastasia Kralli. (2013). Peroxisome proliferator-activated receptor γ coactivator 1 (PGC-1)- and estrogen-related receptor (ERR)-induced regulator in muscle 1 (Perm1) is a tissue-specific regulator of oxidative capacity in skeletal muscle cells. J Biol Chem. 288(35):25207-25218. |
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